Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMF0

Cobll1, Cordon-bleu protein-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cobll1Q3UMF0 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cobll1Q3UMF0 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms