Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULQ2

Pin1rt1, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pin1rt1Q3ULQ2 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms