Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJV1

Ccdc61, Coiled-coil domain-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc61Q3UJV1 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc61Q3UJV1 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc61Q3UJV1 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc61Q3UJV1 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc61Q3UJV1 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc61Q3UJV1 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc61Q3UJV1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc61Q3UJV1 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc61Q3UJV1 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc61Q3UJV1 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc61Q3UJV1 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc61Q3UJV1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc61Q3UJV1 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc61Q3UJV1 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc61Q3UJV1 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc61Q3UJV1 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc61Q3UJV1 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc61Q3UJV1 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc61Q3UJV1 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc61Q3UJV1 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc61Q3UJV1 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms