Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Usp19Q3UJD6 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp19Q3UJD6 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp19Q3UJD6 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp19Q3UJD6 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp19Q3UJD6 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp19Q3UJD6 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp19Q3UJD6 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp19Q3UJD6 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp19Q3UJD6 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp19Q3UJD6 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp19Q3UJD6 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp19Q3UJD6 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp19Q3UJD6 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp19Q3UJD6 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp19Q3UJD6 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp19Q3UJD6 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp19Q3UJD6 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp19Q3UJD6 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp19Q3UJD6 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp19Q3UJD6 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp19Q3UJD6 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp19Q3UJD6 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp19Q3UJD6 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp19Q3UJD6 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp19Q3UJD6 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp19Q3UJD6 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp19Q3UJD6 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp19Q3UJD6 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp19Q3UJD6 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp19Q3UJD6 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp19Q3UJD6 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp19Q3UJD6 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp19Q3UJD6 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp19Q3UJD6 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp19Q3UJD6 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp19Q3UJD6 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp19Q3UJD6 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp19Q3UJD6 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp19Q3UJD6 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp19Q3UJD6 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp19Q3UJD6 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp19Q3UJD6 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp19Q3UJD6 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp19Q3UJD6 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp19Q3UJD6 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp19Q3UJD6 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp19Q3UJD6 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp19Q3UJD6 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp19Q3UJD6 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp19Q3UJD6 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp19Q3UJD6 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp19Q3UJD6 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp19Q3UJD6 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp19Q3UJD6 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp19Q3UJD6 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp19Q3UJD6 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp19Q3UJD6 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp19Q3UJD6 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp19Q3UJD6 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp19Q3UJD6 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp19Q3UJD6 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp19Q3UJD6 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp19Q3UJD6 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp19Q3UJD6 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp19Q3UJD6 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp19Q3UJD6 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp19Q3UJD6 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp19Q3UJD6 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp19Q3UJD6 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp19Q3UJD6 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp19Q3UJD6 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp19Q3UJD6 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp19Q3UJD6 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp19Q3UJD6 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp19Q3UJD6 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp19Q3UJD6 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp19Q3UJD6 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp19Q3UJD6 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp19Q3UJD6 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp19Q3UJD6 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp19Q3UJD6 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp19Q3UJD6 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp19Q3UJD6 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp19Q3UJD6 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp19Q3UJD6 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp19Q3UJD6 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp19Q3UJD6 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp19Q3UJD6 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp19Q3UJD6 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp19Q3UJD6 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp19Q3UJD6 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp19Q3UJD6 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp19Q3UJD6 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp19Q3UJD6 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp19Q3UJD6 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp19Q3UJD6 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp19Q3UJD6 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp19Q3UJD6 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp19Q3UJD6 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms