Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGY8

Arfgef3, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef3Q3UGY8 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Arfgef3Q3UGY8 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Arfgef3Q3UGY8 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Arfgef3Q3UGY8 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Arfgef3Q3UGY8 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Arfgef3Q3UGY8 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Arfgef3Q3UGY8 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Arfgef3Q3UGY8 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Arfgef3Q3UGY8 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Arfgef3Q3UGY8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Arfgef3Q3UGY8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Arfgef3Q3UGY8 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Arfgef3Q3UGY8 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Arfgef3Q3UGY8 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Arfgef3Q3UGY8 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Arfgef3Q3UGY8 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Arfgef3Q3UGY8 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arfgef3Q3UGY8 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Arfgef3Q3UGY8 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Arfgef3Q3UGY8 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arfgef3Q3UGY8 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arfgef3Q3UGY8 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Arfgef3Q3UGY8 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arfgef3Q3UGY8 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Arfgef3Q3UGY8 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arfgef3Q3UGY8 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arfgef3Q3UGY8 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arfgef3Q3UGY8 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arfgef3Q3UGY8 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arfgef3Q3UGY8 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arfgef3Q3UGY8 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arfgef3Q3UGY8 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arfgef3Q3UGY8 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arfgef3Q3UGY8 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arfgef3Q3UGY8 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arfgef3Q3UGY8 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arfgef3Q3UGY8 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arfgef3Q3UGY8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arfgef3Q3UGY8 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arfgef3Q3UGY8 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Arfgef3Q3UGY8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arfgef3Q3UGY8 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arfgef3Q3UGY8 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arfgef3Q3UGY8 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Arfgef3Q3UGY8 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Arfgef3Q3UGY8 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Arfgef3Q3UGY8 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Arfgef3Q3UGY8 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Arfgef3Q3UGY8 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Arfgef3Q3UGY8 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Arfgef3Q3UGY8 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Arfgef3Q3UGY8 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Arfgef3Q3UGY8 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Arfgef3Q3UGY8 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
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Arfgef3Q3UGY8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Arfgef3Q3UGY8 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Arfgef3Q3UGY8 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Arfgef3Q3UGY8 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Arfgef3Q3UGY8 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Arfgef3Q3UGY8 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Arfgef3Q3UGY8 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Arfgef3Q3UGY8 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Arfgef3Q3UGY8 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Arfgef3Q3UGY8 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Arfgef3Q3UGY8 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Arfgef3Q3UGY8 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Arfgef3Q3UGY8 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Arfgef3Q3UGY8 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Arfgef3Q3UGY8 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Arfgef3Q3UGY8 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Arfgef3Q3UGY8 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Arfgef3Q3UGY8 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Arfgef3Q3UGY8 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Arfgef3Q3UGY8 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Arfgef3Q3UGY8 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Arfgef3Q3UGY8 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Arfgef3Q3UGY8 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Arfgef3Q3UGY8 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Arfgef3Q3UGY8 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Arfgef3Q3UGY8 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Arfgef3Q3UGY8 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Arfgef3Q3UGY8 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Arfgef3Q3UGY8 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Arfgef3Q3UGY8 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Arfgef3Q3UGY8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Arfgef3Q3UGY8 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Arfgef3Q3UGY8 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Arfgef3Q3UGY8 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Arfgef3Q3UGY8 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms