Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trip13Q3UA06 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trip13Q3UA06 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trip13Q3UA06 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trip13Q3UA06 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trip13Q3UA06 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Trip13Q3UA06 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trip13Q3UA06 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trip13Q3UA06 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trip13Q3UA06 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trip13Q3UA06 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trip13Q3UA06 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trip13Q3UA06 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trip13Q3UA06 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trip13Q3UA06 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trip13Q3UA06 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trip13Q3UA06 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trip13Q3UA06 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trip13Q3UA06 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trip13Q3UA06 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trip13Q3UA06 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trip13Q3UA06 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trip13Q3UA06 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trip13Q3UA06 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trip13Q3UA06 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trip13Q3UA06 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Trip13Q3UA06 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trip13Q3UA06 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trip13Q3UA06 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trip13Q3UA06 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trip13Q3UA06 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trip13Q3UA06 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trip13Q3UA06 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trip13Q3UA06 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trip13Q3UA06 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trip13Q3UA06 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trip13Q3UA06 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Trip13Q3UA06 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trip13Q3UA06 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms