Protein–RNA interactions for Protein: Q3U5F4

Yrdc, YrdC domain-containing protein, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YrdcQ3U5F4 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
YrdcQ3U5F4 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
YrdcQ3U5F4 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
YrdcQ3U5F4 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
YrdcQ3U5F4 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
YrdcQ3U5F4 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
YrdcQ3U5F4 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
YrdcQ3U5F4 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
YrdcQ3U5F4 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
YrdcQ3U5F4 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
YrdcQ3U5F4 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
YrdcQ3U5F4 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
YrdcQ3U5F4 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
YrdcQ3U5F4 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
YrdcQ3U5F4 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
YrdcQ3U5F4 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
YrdcQ3U5F4 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
YrdcQ3U5F4 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
YrdcQ3U5F4 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
YrdcQ3U5F4 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
YrdcQ3U5F4 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
YrdcQ3U5F4 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
YrdcQ3U5F4 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
YrdcQ3U5F4 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
YrdcQ3U5F4 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
YrdcQ3U5F4 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
YrdcQ3U5F4 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
YrdcQ3U5F4 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
YrdcQ3U5F4 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
YrdcQ3U5F4 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
YrdcQ3U5F4 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
YrdcQ3U5F4 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
YrdcQ3U5F4 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
YrdcQ3U5F4 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
YrdcQ3U5F4 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
YrdcQ3U5F4 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
YrdcQ3U5F4 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
YrdcQ3U5F4 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
YrdcQ3U5F4 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
YrdcQ3U5F4 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
YrdcQ3U5F4 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
YrdcQ3U5F4 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
YrdcQ3U5F4 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
YrdcQ3U5F4 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
YrdcQ3U5F4 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
YrdcQ3U5F4 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
YrdcQ3U5F4 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
YrdcQ3U5F4 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
YrdcQ3U5F4 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
YrdcQ3U5F4 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
YrdcQ3U5F4 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
YrdcQ3U5F4 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
YrdcQ3U5F4 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
YrdcQ3U5F4 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
YrdcQ3U5F4 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
YrdcQ3U5F4 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
YrdcQ3U5F4 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
YrdcQ3U5F4 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
YrdcQ3U5F4 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
YrdcQ3U5F4 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
YrdcQ3U5F4 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
YrdcQ3U5F4 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
YrdcQ3U5F4 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
YrdcQ3U5F4 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
YrdcQ3U5F4 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
YrdcQ3U5F4 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
YrdcQ3U5F4 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
YrdcQ3U5F4 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
YrdcQ3U5F4 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
YrdcQ3U5F4 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
YrdcQ3U5F4 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
YrdcQ3U5F4 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
YrdcQ3U5F4 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
YrdcQ3U5F4 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
YrdcQ3U5F4 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
YrdcQ3U5F4 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
YrdcQ3U5F4 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
YrdcQ3U5F4 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
YrdcQ3U5F4 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
YrdcQ3U5F4 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
YrdcQ3U5F4 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
YrdcQ3U5F4 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
YrdcQ3U5F4 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
YrdcQ3U5F4 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
YrdcQ3U5F4 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
YrdcQ3U5F4 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
YrdcQ3U5F4 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
YrdcQ3U5F4 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
YrdcQ3U5F4 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
YrdcQ3U5F4 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
YrdcQ3U5F4 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
YrdcQ3U5F4 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
YrdcQ3U5F4 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
YrdcQ3U5F4 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
YrdcQ3U5F4 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
YrdcQ3U5F4 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
YrdcQ3U5F4 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
YrdcQ3U5F4 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
YrdcQ3U5F4 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
YrdcQ3U5F4 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms