Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

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Length 105 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q3U595 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q3U595 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q3U595 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q3U595 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q3U595 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q3U595 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q3U595 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Q3U595 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Q3U595 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q3U595 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q3U595 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q3U595 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q3U595 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q3U595 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q3U595 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q3U595 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q3U595 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q3U595 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q3U595 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q3U595 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q3U595 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q3U595 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q3U595 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q3U595 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q3U595 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q3U595 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q3U595 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q3U595 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q3U595 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q3U595 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q3U595 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q3U595 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q3U595 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q3U595 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q3U595 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q3U595 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q3U595 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q3U595 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q3U595 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q3U595 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q3U595 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q3U595 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q3U595 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q3U595 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q3U595 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q3U595 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q3U595 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q3U595 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q3U595 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q3U595 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Q3U595 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q3U595 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q3U595 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q3U595 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q3U595 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q3U595 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q3U595 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q3U595 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q3U595 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q3U595 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q3U595 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q3U595 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q3U595 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q3U595 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q3U595 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q3U595 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q3U595 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q3U595 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q3U595 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q3U595 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q3U595 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q3U595 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q3U595 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q3U595 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q3U595 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q3U595 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q3U595 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q3U595 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q3U595 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q3U595 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q3U595 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q3U595 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q3U595 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q3U595 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q3U595 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q3U595 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q3U595 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q3U595 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q3U595 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q3U595 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q3U595 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q3U595 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q3U595 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q3U595 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q3U595 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q3U595 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q3U595 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q3U595 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q3U595 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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