Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Ulk3Q3U3Q1 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Ulk3Q3U3Q1 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Ulk3Q3U3Q1 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Ulk3Q3U3Q1 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ulk3Q3U3Q1 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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