Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kdm4dQ3U2K5 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kdm4dQ3U2K5 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kdm4dQ3U2K5 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kdm4dQ3U2K5 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kdm4dQ3U2K5 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kdm4dQ3U2K5 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kdm4dQ3U2K5 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Kdm4dQ3U2K5 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kdm4dQ3U2K5 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Kdm4dQ3U2K5 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kdm4dQ3U2K5 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kdm4dQ3U2K5 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kdm4dQ3U2K5 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kdm4dQ3U2K5 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kdm4dQ3U2K5 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kdm4dQ3U2K5 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kdm4dQ3U2K5 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kdm4dQ3U2K5 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kdm4dQ3U2K5 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Kdm4dQ3U2K5 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kdm4dQ3U2K5 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kdm4dQ3U2K5 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kdm4dQ3U2K5 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kdm4dQ3U2K5 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kdm4dQ3U2K5 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kdm4dQ3U2K5 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kdm4dQ3U2K5 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kdm4dQ3U2K5 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kdm4dQ3U2K5 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kdm4dQ3U2K5 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Kdm4dQ3U2K5 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Kdm4dQ3U2K5 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kdm4dQ3U2K5 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kdm4dQ3U2K5 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kdm4dQ3U2K5 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kdm4dQ3U2K5 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kdm4dQ3U2K5 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kdm4dQ3U2K5 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kdm4dQ3U2K5 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kdm4dQ3U2K5 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kdm4dQ3U2K5 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kdm4dQ3U2K5 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kdm4dQ3U2K5 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kdm4dQ3U2K5 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kdm4dQ3U2K5 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kdm4dQ3U2K5 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kdm4dQ3U2K5 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kdm4dQ3U2K5 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kdm4dQ3U2K5 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kdm4dQ3U2K5 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kdm4dQ3U2K5 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kdm4dQ3U2K5 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kdm4dQ3U2K5 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kdm4dQ3U2K5 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Kdm4dQ3U2K5 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kdm4dQ3U2K5 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kdm4dQ3U2K5 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kdm4dQ3U2K5 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kdm4dQ3U2K5 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kdm4dQ3U2K5 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Kdm4dQ3U2K5 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kdm4dQ3U2K5 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kdm4dQ3U2K5 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kdm4dQ3U2K5 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kdm4dQ3U2K5 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kdm4dQ3U2K5 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kdm4dQ3U2K5 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kdm4dQ3U2K5 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kdm4dQ3U2K5 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kdm4dQ3U2K5 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kdm4dQ3U2K5 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kdm4dQ3U2K5 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kdm4dQ3U2K5 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Kdm4dQ3U2K5 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kdm4dQ3U2K5 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kdm4dQ3U2K5 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kdm4dQ3U2K5 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Kdm4dQ3U2K5 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Kdm4dQ3U2K5 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kdm4dQ3U2K5 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kdm4dQ3U2K5 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Kdm4dQ3U2K5 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Kdm4dQ3U2K5 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kdm4dQ3U2K5 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kdm4dQ3U2K5 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kdm4dQ3U2K5 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kdm4dQ3U2K5 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kdm4dQ3U2K5 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kdm4dQ3U2K5 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Kdm4dQ3U2K5 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Kdm4dQ3U2K5 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Kdm4dQ3U2K5 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Kdm4dQ3U2K5 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Kdm4dQ3U2K5 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Kdm4dQ3U2K5 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Kdm4dQ3U2K5 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Kdm4dQ3U2K5 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdm4dQ3U2K5 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kdm4dQ3U2K5 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms