Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc174Q3U155 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc174Q3U155 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc174Q3U155 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc174Q3U155 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc174Q3U155 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc174Q3U155 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc174Q3U155 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc174Q3U155 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc174Q3U155 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc174Q3U155 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc174Q3U155 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc174Q3U155 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc174Q3U155 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc174Q3U155 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc174Q3U155 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc174Q3U155 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc174Q3U155 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc174Q3U155 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc174Q3U155 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc174Q3U155 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc174Q3U155 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc174Q3U155 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc174Q3U155 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc174Q3U155 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc174Q3U155 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc174Q3U155 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc174Q3U155 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc174Q3U155 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc174Q3U155 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc174Q3U155 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc174Q3U155 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc174Q3U155 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc174Q3U155 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc174Q3U155 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc174Q3U155 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc174Q3U155 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc174Q3U155 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc174Q3U155 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc174Q3U155 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc174Q3U155 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc174Q3U155 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc174Q3U155 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc174Q3U155 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc174Q3U155 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccdc174Q3U155 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccdc174Q3U155 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccdc174Q3U155 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccdc174Q3U155 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc174Q3U155 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc174Q3U155 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc174Q3U155 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc174Q3U155 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc174Q3U155 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc174Q3U155 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc174Q3U155 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc174Q3U155 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc174Q3U155 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc174Q3U155 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc174Q3U155 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc174Q3U155 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc174Q3U155 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc174Q3U155 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc174Q3U155 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc174Q3U155 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc174Q3U155 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc174Q3U155 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc174Q3U155 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc174Q3U155 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc174Q3U155 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc174Q3U155 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc174Q3U155 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc174Q3U155 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc174Q3U155 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc174Q3U155 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc174Q3U155 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc174Q3U155 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc174Q3U155 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc174Q3U155 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc174Q3U155 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc174Q3U155 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc174Q3U155 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc174Q3U155 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc174Q3U155 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc174Q3U155 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc174Q3U155 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc174Q3U155 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc174Q3U155 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc174Q3U155 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc174Q3U155 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc174Q3U155 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc174Q3U155 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc174Q3U155 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc174Q3U155 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc174Q3U155 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc174Q3U155 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc174Q3U155 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc174Q3U155 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc174Q3U155 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc174Q3U155 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms