Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0A6

Hbq1b, Globin d1, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hbq1bQ3U0A6 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hbq1bQ3U0A6 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hbq1bQ3U0A6 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hbq1bQ3U0A6 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hbq1bQ3U0A6 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hbq1bQ3U0A6 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hbq1bQ3U0A6 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hbq1bQ3U0A6 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hbq1bQ3U0A6 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hbq1bQ3U0A6 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hbq1bQ3U0A6 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hbq1bQ3U0A6 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hbq1bQ3U0A6 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hbq1bQ3U0A6 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hbq1bQ3U0A6 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hbq1bQ3U0A6 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hbq1bQ3U0A6 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hbq1bQ3U0A6 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hbq1bQ3U0A6 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hbq1bQ3U0A6 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hbq1bQ3U0A6 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hbq1bQ3U0A6 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hbq1bQ3U0A6 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hbq1bQ3U0A6 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hbq1bQ3U0A6 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hbq1bQ3U0A6 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hbq1bQ3U0A6 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hbq1bQ3U0A6 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hbq1bQ3U0A6 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hbq1bQ3U0A6 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hbq1bQ3U0A6 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hbq1bQ3U0A6 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hbq1bQ3U0A6 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hbq1bQ3U0A6 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hbq1bQ3U0A6 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hbq1bQ3U0A6 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hbq1bQ3U0A6 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hbq1bQ3U0A6 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hbq1bQ3U0A6 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hbq1bQ3U0A6 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hbq1bQ3U0A6 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hbq1bQ3U0A6 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hbq1bQ3U0A6 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hbq1bQ3U0A6 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hbq1bQ3U0A6 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hbq1bQ3U0A6 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hbq1bQ3U0A6 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hbq1bQ3U0A6 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hbq1bQ3U0A6 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hbq1bQ3U0A6 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hbq1bQ3U0A6 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hbq1bQ3U0A6 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hbq1bQ3U0A6 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hbq1bQ3U0A6 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hbq1bQ3U0A6 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hbq1bQ3U0A6 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hbq1bQ3U0A6 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hbq1bQ3U0A6 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hbq1bQ3U0A6 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hbq1bQ3U0A6 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hbq1bQ3U0A6 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hbq1bQ3U0A6 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hbq1bQ3U0A6 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hbq1bQ3U0A6 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hbq1bQ3U0A6 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Hbq1bQ3U0A6 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hbq1bQ3U0A6 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hbq1bQ3U0A6 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hbq1bQ3U0A6 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hbq1bQ3U0A6 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hbq1bQ3U0A6 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hbq1bQ3U0A6 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hbq1bQ3U0A6 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hbq1bQ3U0A6 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hbq1bQ3U0A6 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hbq1bQ3U0A6 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hbq1bQ3U0A6 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hbq1bQ3U0A6 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hbq1bQ3U0A6 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hbq1bQ3U0A6 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hbq1bQ3U0A6 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hbq1bQ3U0A6 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hbq1bQ3U0A6 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hbq1bQ3U0A6 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hbq1bQ3U0A6 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hbq1bQ3U0A6 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Hbq1bQ3U0A6 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hbq1bQ3U0A6 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hbq1bQ3U0A6 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hbq1bQ3U0A6 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hbq1bQ3U0A6 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hbq1bQ3U0A6 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hbq1bQ3U0A6 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hbq1bQ3U0A6 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hbq1bQ3U0A6 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hbq1bQ3U0A6 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hbq1bQ3U0A6 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hbq1bQ3U0A6 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hbq1bQ3U0A6 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hbq1bQ3U0A6 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms