Protein–RNA interactions for Protein: Q3TZA2

Cdkl4, Cyclin-dependent kinase-like 4, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl4Q3TZA2 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdkl4Q3TZA2 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdkl4Q3TZA2 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdkl4Q3TZA2 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdkl4Q3TZA2 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdkl4Q3TZA2 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdkl4Q3TZA2 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdkl4Q3TZA2 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdkl4Q3TZA2 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdkl4Q3TZA2 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdkl4Q3TZA2 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdkl4Q3TZA2 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdkl4Q3TZA2 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdkl4Q3TZA2 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdkl4Q3TZA2 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdkl4Q3TZA2 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdkl4Q3TZA2 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdkl4Q3TZA2 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdkl4Q3TZA2 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdkl4Q3TZA2 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdkl4Q3TZA2 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdkl4Q3TZA2 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdkl4Q3TZA2 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdkl4Q3TZA2 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdkl4Q3TZA2 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdkl4Q3TZA2 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdkl4Q3TZA2 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdkl4Q3TZA2 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdkl4Q3TZA2 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdkl4Q3TZA2 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdkl4Q3TZA2 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdkl4Q3TZA2 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdkl4Q3TZA2 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdkl4Q3TZA2 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdkl4Q3TZA2 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdkl4Q3TZA2 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdkl4Q3TZA2 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdkl4Q3TZA2 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdkl4Q3TZA2 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdkl4Q3TZA2 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdkl4Q3TZA2 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdkl4Q3TZA2 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdkl4Q3TZA2 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdkl4Q3TZA2 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdkl4Q3TZA2 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdkl4Q3TZA2 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdkl4Q3TZA2 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdkl4Q3TZA2 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdkl4Q3TZA2 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdkl4Q3TZA2 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdkl4Q3TZA2 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdkl4Q3TZA2 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdkl4Q3TZA2 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdkl4Q3TZA2 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdkl4Q3TZA2 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdkl4Q3TZA2 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdkl4Q3TZA2 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdkl4Q3TZA2 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdkl4Q3TZA2 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdkl4Q3TZA2 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdkl4Q3TZA2 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdkl4Q3TZA2 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdkl4Q3TZA2 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdkl4Q3TZA2 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdkl4Q3TZA2 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdkl4Q3TZA2 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdkl4Q3TZA2 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdkl4Q3TZA2 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdkl4Q3TZA2 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdkl4Q3TZA2 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdkl4Q3TZA2 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdkl4Q3TZA2 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdkl4Q3TZA2 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdkl4Q3TZA2 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdkl4Q3TZA2 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdkl4Q3TZA2 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdkl4Q3TZA2 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdkl4Q3TZA2 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdkl4Q3TZA2 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdkl4Q3TZA2 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdkl4Q3TZA2 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdkl4Q3TZA2 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdkl4Q3TZA2 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdkl4Q3TZA2 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdkl4Q3TZA2 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdkl4Q3TZA2 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdkl4Q3TZA2 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdkl4Q3TZA2 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdkl4Q3TZA2 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdkl4Q3TZA2 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdkl4Q3TZA2 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdkl4Q3TZA2 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdkl4Q3TZA2 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdkl4Q3TZA2 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdkl4Q3TZA2 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdkl4Q3TZA2 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdkl4Q3TZA2 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdkl4Q3TZA2 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdkl4Q3TZA2 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdkl4Q3TZA2 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms