Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXT3

Inip, SOSS complex subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
InipQ3TXT3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
InipQ3TXT3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
InipQ3TXT3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
InipQ3TXT3 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
InipQ3TXT3 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
InipQ3TXT3 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
InipQ3TXT3 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
InipQ3TXT3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
InipQ3TXT3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
InipQ3TXT3 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
InipQ3TXT3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
InipQ3TXT3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
InipQ3TXT3 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
InipQ3TXT3 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
InipQ3TXT3 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
InipQ3TXT3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
InipQ3TXT3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
InipQ3TXT3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
InipQ3TXT3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
InipQ3TXT3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
InipQ3TXT3 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
InipQ3TXT3 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
InipQ3TXT3 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
InipQ3TXT3 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
InipQ3TXT3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
InipQ3TXT3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
InipQ3TXT3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
InipQ3TXT3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
InipQ3TXT3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
InipQ3TXT3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
InipQ3TXT3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
InipQ3TXT3 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
InipQ3TXT3 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
InipQ3TXT3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
InipQ3TXT3 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
InipQ3TXT3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
InipQ3TXT3 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
InipQ3TXT3 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
InipQ3TXT3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
InipQ3TXT3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
InipQ3TXT3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
InipQ3TXT3 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
InipQ3TXT3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
InipQ3TXT3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
InipQ3TXT3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
InipQ3TXT3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
InipQ3TXT3 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
InipQ3TXT3 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
InipQ3TXT3 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
InipQ3TXT3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
InipQ3TXT3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
InipQ3TXT3 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
InipQ3TXT3 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
InipQ3TXT3 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
InipQ3TXT3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
InipQ3TXT3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
InipQ3TXT3 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
InipQ3TXT3 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
InipQ3TXT3 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
InipQ3TXT3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
InipQ3TXT3 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
InipQ3TXT3 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
InipQ3TXT3 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
InipQ3TXT3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
InipQ3TXT3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
InipQ3TXT3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
InipQ3TXT3 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
InipQ3TXT3 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
InipQ3TXT3 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
InipQ3TXT3 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
InipQ3TXT3 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
InipQ3TXT3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
InipQ3TXT3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
InipQ3TXT3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
InipQ3TXT3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
InipQ3TXT3 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
InipQ3TXT3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
InipQ3TXT3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
InipQ3TXT3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
InipQ3TXT3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
InipQ3TXT3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
InipQ3TXT3 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
InipQ3TXT3 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
InipQ3TXT3 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
InipQ3TXT3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
InipQ3TXT3 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
InipQ3TXT3 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
InipQ3TXT3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
InipQ3TXT3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
InipQ3TXT3 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
InipQ3TXT3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
InipQ3TXT3 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
InipQ3TXT3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
InipQ3TXT3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
InipQ3TXT3 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
InipQ3TXT3 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
InipQ3TXT3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
InipQ3TXT3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
InipQ3TXT3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
InipQ3TXT3 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms