Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVW5

Tchp, Trichoplein keratin filament-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TchpQ3TVW5 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TchpQ3TVW5 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TchpQ3TVW5 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms