Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccndbp1Q3TVC7 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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