Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ccdc136Q3TVA9 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ccdc136Q3TVA9 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ccdc136Q3TVA9 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Ccdc136Q3TVA9 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ccdc136Q3TVA9 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ccdc136Q3TVA9 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ccdc136Q3TVA9 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ccdc136Q3TVA9 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ccdc136Q3TVA9 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ccdc136Q3TVA9 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccdc136Q3TVA9 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccdc136Q3TVA9 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccdc136Q3TVA9 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccdc136Q3TVA9 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccdc136Q3TVA9 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccdc136Q3TVA9 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccdc136Q3TVA9 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccdc136Q3TVA9 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccdc136Q3TVA9 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccdc136Q3TVA9 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Ccdc136Q3TVA9 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Ccdc136Q3TVA9 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ccdc136Q3TVA9 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ccdc136Q3TVA9 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ccdc136Q3TVA9 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ccdc136Q3TVA9 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ccdc136Q3TVA9 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ccdc136Q3TVA9 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ccdc136Q3TVA9 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ccdc136Q3TVA9 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ccdc136Q3TVA9 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ccdc136Q3TVA9 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ccdc136Q3TVA9 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ccdc136Q3TVA9 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ccdc136Q3TVA9 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ccdc136Q3TVA9 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Ccdc136Q3TVA9 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ccdc136Q3TVA9 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ccdc136Q3TVA9 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Ccdc136Q3TVA9 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Ccdc136Q3TVA9 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ccdc136Q3TVA9 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ccdc136Q3TVA9 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ccdc136Q3TVA9 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ccdc136Q3TVA9 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ccdc136Q3TVA9 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ccdc136Q3TVA9 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ccdc136Q3TVA9 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ccdc136Q3TVA9 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ccdc136Q3TVA9 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ccdc136Q3TVA9 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ccdc136Q3TVA9 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Ccdc136Q3TVA9 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ccdc136Q3TVA9 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Ccdc136Q3TVA9 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ccdc136Q3TVA9 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Ccdc136Q3TVA9 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ccdc136Q3TVA9 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ccdc136Q3TVA9 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ccdc136Q3TVA9 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ccdc136Q3TVA9 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ccdc136Q3TVA9 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ccdc136Q3TVA9 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ccdc136Q3TVA9 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ccdc136Q3TVA9 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ccdc136Q3TVA9 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ccdc136Q3TVA9 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ccdc136Q3TVA9 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ccdc136Q3TVA9 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ccdc136Q3TVA9 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ccdc136Q3TVA9 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ccdc136Q3TVA9 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ccdc136Q3TVA9 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ccdc136Q3TVA9 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ccdc136Q3TVA9 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ccdc136Q3TVA9 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ccdc136Q3TVA9 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ccdc136Q3TVA9 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ccdc136Q3TVA9 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ccdc136Q3TVA9 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ccdc136Q3TVA9 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ccdc136Q3TVA9 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccdc136Q3TVA9 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccdc136Q3TVA9 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccdc136Q3TVA9 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccdc136Q3TVA9 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccdc136Q3TVA9 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccdc136Q3TVA9 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccdc136Q3TVA9 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccdc136Q3TVA9 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccdc136Q3TVA9 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccdc136Q3TVA9 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccdc136Q3TVA9 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccdc136Q3TVA9 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccdc136Q3TVA9 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccdc136Q3TVA9 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccdc136Q3TVA9 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccdc136Q3TVA9 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccdc136Q3TVA9 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms