Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc13Q3TIR1 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc13Q3TIR1 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms