Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Prr27Q3SYJ2 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Prr27Q3SYJ2 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Prr27Q3SYJ2 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Prr27Q3SYJ2 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Prr27Q3SYJ2 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Prr27Q3SYJ2 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Prr27Q3SYJ2 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Prr27Q3SYJ2 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Prr27Q3SYJ2 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Prr27Q3SYJ2 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Prr27Q3SYJ2 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Prr27Q3SYJ2 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Prr27Q3SYJ2 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Prr27Q3SYJ2 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Prr27Q3SYJ2 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Prr27Q3SYJ2 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Prr27Q3SYJ2 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Prr27Q3SYJ2 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Prr27Q3SYJ2 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Prr27Q3SYJ2 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Prr27Q3SYJ2 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Prr27Q3SYJ2 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Prr27Q3SYJ2 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Prr27Q3SYJ2 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Prr27Q3SYJ2 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Prr27Q3SYJ2 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Prr27Q3SYJ2 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Prr27Q3SYJ2 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Prr27Q3SYJ2 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Prr27Q3SYJ2 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Prr27Q3SYJ2 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Prr27Q3SYJ2 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Prr27Q3SYJ2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Prr27Q3SYJ2 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Prr27Q3SYJ2 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Prr27Q3SYJ2 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Prr27Q3SYJ2 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Prr27Q3SYJ2 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Prr27Q3SYJ2 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Prr27Q3SYJ2 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Prr27Q3SYJ2 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Prr27Q3SYJ2 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Prr27Q3SYJ2 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Prr27Q3SYJ2 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Prr27Q3SYJ2 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Prr27Q3SYJ2 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Prr27Q3SYJ2 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Prr27Q3SYJ2 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Prr27Q3SYJ2 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Prr27Q3SYJ2 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Prr27Q3SYJ2 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Prr27Q3SYJ2 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Prr27Q3SYJ2 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Prr27Q3SYJ2 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Prr27Q3SYJ2 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Prr27Q3SYJ2 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Prr27Q3SYJ2 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Prr27Q3SYJ2 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Prr27Q3SYJ2 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Prr27Q3SYJ2 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Prr27Q3SYJ2 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Prr27Q3SYJ2 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Prr27Q3SYJ2 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Prr27Q3SYJ2 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Prr27Q3SYJ2 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Prr27Q3SYJ2 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Prr27Q3SYJ2 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Prr27Q3SYJ2 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Prr27Q3SYJ2 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Prr27Q3SYJ2 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Prr27Q3SYJ2 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Prr27Q3SYJ2 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Prr27Q3SYJ2 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Prr27Q3SYJ2 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Prr27Q3SYJ2 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Prr27Q3SYJ2 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Prr27Q3SYJ2 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Prr27Q3SYJ2 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Prr27Q3SYJ2 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Prr27Q3SYJ2 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Prr27Q3SYJ2 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Prr27Q3SYJ2 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Prr27Q3SYJ2 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Prr27Q3SYJ2 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Prr27Q3SYJ2 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Prr27Q3SYJ2 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Prr27Q3SYJ2 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Prr27Q3SYJ2 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Prr27Q3SYJ2 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Prr27Q3SYJ2 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Prr27Q3SYJ2 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Prr27Q3SYJ2 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Prr27Q3SYJ2 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Prr27Q3SYJ2 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Prr27Q3SYJ2 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Prr27Q3SYJ2 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Prr27Q3SYJ2 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Prr27Q3SYJ2 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Prr27Q3SYJ2 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms