Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNL4

UPF0728 protein C10orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3KNL4 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3KNL4 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Q3KNL4 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3KNL4 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3KNL4 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3KNL4 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3KNL4 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3KNL4 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3KNL4 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3KNL4 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3KNL4 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3KNL4 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3KNL4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3KNL4 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3KNL4 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3KNL4 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3KNL4 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3KNL4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3KNL4 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3KNL4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3KNL4 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3KNL4 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3KNL4 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3KNL4 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3KNL4 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3KNL4 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3KNL4 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3KNL4 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3KNL4 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3KNL4 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3KNL4 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3KNL4 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3KNL4 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3KNL4 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3KNL4 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3KNL4 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3KNL4 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3KNL4 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3KNL4 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3KNL4 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3KNL4 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3KNL4 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3KNL4 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3KNL4 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3KNL4 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3KNL4 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3KNL4 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3KNL4 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3KNL4 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3KNL4 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3KNL4 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3KNL4 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3KNL4 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3KNL4 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3KNL4 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3KNL4 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms