Protein–RNA interactions for Protein: Q33DR3

Pdss2, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdss2Q33DR3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pdss2Q33DR3 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pdss2Q33DR3 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pdss2Q33DR3 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdss2Q33DR3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdss2Q33DR3 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdss2Q33DR3 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdss2Q33DR3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pdss2Q33DR3 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Pdss2Q33DR3 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pdss2Q33DR3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdss2Q33DR3 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdss2Q33DR3 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdss2Q33DR3 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdss2Q33DR3 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdss2Q33DR3 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdss2Q33DR3 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdss2Q33DR3 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pdss2Q33DR3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdss2Q33DR3 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdss2Q33DR3 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdss2Q33DR3 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdss2Q33DR3 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdss2Q33DR3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdss2Q33DR3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pdss2Q33DR3 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdss2Q33DR3 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdss2Q33DR3 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdss2Q33DR3 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdss2Q33DR3 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdss2Q33DR3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pdss2Q33DR3 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdss2Q33DR3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Pdss2Q33DR3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pdss2Q33DR3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Pdss2Q33DR3 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdss2Q33DR3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdss2Q33DR3 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdss2Q33DR3 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdss2Q33DR3 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdss2Q33DR3 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdss2Q33DR3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pdss2Q33DR3 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pdss2Q33DR3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdss2Q33DR3 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pdss2Q33DR3 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdss2Q33DR3 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdss2Q33DR3 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdss2Q33DR3 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdss2Q33DR3 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdss2Q33DR3 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdss2Q33DR3 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdss2Q33DR3 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdss2Q33DR3 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdss2Q33DR3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdss2Q33DR3 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdss2Q33DR3 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdss2Q33DR3 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdss2Q33DR3 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdss2Q33DR3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdss2Q33DR3 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pdss2Q33DR3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Pdss2Q33DR3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Pdss2Q33DR3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Pdss2Q33DR3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdss2Q33DR3 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdss2Q33DR3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pdss2Q33DR3 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdss2Q33DR3 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdss2Q33DR3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdss2Q33DR3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdss2Q33DR3 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pdss2Q33DR3 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdss2Q33DR3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdss2Q33DR3 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdss2Q33DR3 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdss2Q33DR3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pdss2Q33DR3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pdss2Q33DR3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pdss2Q33DR3 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pdss2Q33DR3 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdss2Q33DR3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pdss2Q33DR3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdss2Q33DR3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdss2Q33DR3 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pdss2Q33DR3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdss2Q33DR3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pdss2Q33DR3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdss2Q33DR3 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdss2Q33DR3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdss2Q33DR3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdss2Q33DR3 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdss2Q33DR3 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdss2Q33DR3 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Pdss2Q33DR3 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdss2Q33DR3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pdss2Q33DR3 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdss2Q33DR3 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdss2Q33DR3 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdss2Q33DR3 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms