Protein–RNA interactions for Protein: Q2QI47

Ush2A, Usherin, mousemouse

Predictions only

Length 5,193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush2AQ2QI47 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ush2AQ2QI47 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ush2AQ2QI47 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ush2AQ2QI47 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ush2AQ2QI47 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ush2AQ2QI47 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ush2AQ2QI47 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ush2AQ2QI47 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ush2AQ2QI47 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ush2AQ2QI47 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Ush2AQ2QI47 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ush2AQ2QI47 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ush2AQ2QI47 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ush2AQ2QI47 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ush2AQ2QI47 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ush2AQ2QI47 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ush2AQ2QI47 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Ush2AQ2QI47 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Ush2AQ2QI47 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Ush2AQ2QI47 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ush2AQ2QI47 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ush2AQ2QI47 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ush2AQ2QI47 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Ush2AQ2QI47 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ush2AQ2QI47 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ush2AQ2QI47 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ush2AQ2QI47 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Ush2AQ2QI47 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ush2AQ2QI47 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ush2AQ2QI47 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ush2AQ2QI47 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ush2AQ2QI47 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ush2AQ2QI47 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Ush2AQ2QI47 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ush2AQ2QI47 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ush2AQ2QI47 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ush2AQ2QI47 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ush2AQ2QI47 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ush2AQ2QI47 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ush2AQ2QI47 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ush2AQ2QI47 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ush2AQ2QI47 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ush2AQ2QI47 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ush2AQ2QI47 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Ush2AQ2QI47 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ush2AQ2QI47 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ush2AQ2QI47 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ush2AQ2QI47 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ush2AQ2QI47 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ush2AQ2QI47 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ush2AQ2QI47 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ush2AQ2QI47 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ush2AQ2QI47 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ush2AQ2QI47 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Ush2AQ2QI47 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ush2AQ2QI47 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ush2AQ2QI47 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Ush2AQ2QI47 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ush2AQ2QI47 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ush2AQ2QI47 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ush2AQ2QI47 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ush2AQ2QI47 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ush2AQ2QI47 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ush2AQ2QI47 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Ush2AQ2QI47 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Ush2AQ2QI47 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Ush2AQ2QI47 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Ush2AQ2QI47 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Ush2AQ2QI47 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Ush2AQ2QI47 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Ush2AQ2QI47 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Ush2AQ2QI47 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Ush2AQ2QI47 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Ush2AQ2QI47 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Ush2AQ2QI47 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Ush2AQ2QI47 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Ush2AQ2QI47 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Ush2AQ2QI47 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Ush2AQ2QI47 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Ush2AQ2QI47 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Ush2AQ2QI47 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Ush2AQ2QI47 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Ush2AQ2QI47 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Ush2AQ2QI47 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Ush2AQ2QI47 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Ush2AQ2QI47 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Ush2AQ2QI47 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Ush2AQ2QI47 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Ush2AQ2QI47 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Ush2AQ2QI47 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Ush2AQ2QI47 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Ush2AQ2QI47 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Ush2AQ2QI47 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Ush2AQ2QI47 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Ush2AQ2QI47 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Ush2AQ2QI47 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Ush2AQ2QI47 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Ush2AQ2QI47 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Ush2AQ2QI47 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Ush2AQ2QI47 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms