Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Shroom4Q1W617 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
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Shroom4Q1W617 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
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Shroom4Q1W617 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Shroom4Q1W617 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Shroom4Q1W617 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Shroom4Q1W617 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Shroom4Q1W617 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Shroom4Q1W617 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
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Shroom4Q1W617 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Shroom4Q1W617 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Shroom4Q1W617 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Shroom4Q1W617 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Shroom4Q1W617 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Shroom4Q1W617 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Shroom4Q1W617 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Shroom4Q1W617 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Shroom4Q1W617 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Shroom4Q1W617 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Shroom4Q1W617 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Shroom4Q1W617 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Shroom4Q1W617 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Shroom4Q1W617 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Shroom4Q1W617 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Shroom4Q1W617 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Shroom4Q1W617 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Shroom4Q1W617 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
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