Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

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Length 542 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Samd11Q1RNF8 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Samd11Q1RNF8 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Samd11Q1RNF8 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Samd11Q1RNF8 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Samd11Q1RNF8 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Samd11Q1RNF8 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Samd11Q1RNF8 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Samd11Q1RNF8 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Samd11Q1RNF8 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Samd11Q1RNF8 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Samd11Q1RNF8 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Samd11Q1RNF8 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Samd11Q1RNF8 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Samd11Q1RNF8 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Samd11Q1RNF8 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Samd11Q1RNF8 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Samd11Q1RNF8 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Samd11Q1RNF8 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Samd11Q1RNF8 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Samd11Q1RNF8 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Samd11Q1RNF8 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Samd11Q1RNF8 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Samd11Q1RNF8 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Samd11Q1RNF8 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Samd11Q1RNF8 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Samd11Q1RNF8 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Samd11Q1RNF8 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Samd11Q1RNF8 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Samd11Q1RNF8 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Samd11Q1RNF8 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Samd11Q1RNF8 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Samd11Q1RNF8 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Samd11Q1RNF8 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Samd11Q1RNF8 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Samd11Q1RNF8 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Samd11Q1RNF8 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Samd11Q1RNF8 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Samd11Q1RNF8 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Samd11Q1RNF8 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Samd11Q1RNF8 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Samd11Q1RNF8 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Samd11Q1RNF8 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Samd11Q1RNF8 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Samd11Q1RNF8 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Samd11Q1RNF8 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Samd11Q1RNF8 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Samd11Q1RNF8 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Samd11Q1RNF8 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Samd11Q1RNF8 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Samd11Q1RNF8 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Samd11Q1RNF8 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Samd11Q1RNF8 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Samd11Q1RNF8 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Samd11Q1RNF8 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Samd11Q1RNF8 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Samd11Q1RNF8 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Samd11Q1RNF8 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Samd11Q1RNF8 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Samd11Q1RNF8 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Samd11Q1RNF8 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Samd11Q1RNF8 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Samd11Q1RNF8 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Samd11Q1RNF8 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Samd11Q1RNF8 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Samd11Q1RNF8 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Samd11Q1RNF8 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Samd11Q1RNF8 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Samd11Q1RNF8 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Samd11Q1RNF8 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Samd11Q1RNF8 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Samd11Q1RNF8 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Samd11Q1RNF8 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Samd11Q1RNF8 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Samd11Q1RNF8 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Samd11Q1RNF8 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Samd11Q1RNF8 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Samd11Q1RNF8 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Samd11Q1RNF8 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Samd11Q1RNF8 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Samd11Q1RNF8 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Samd11Q1RNF8 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Samd11Q1RNF8 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Samd11Q1RNF8 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Samd11Q1RNF8 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Samd11Q1RNF8 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Samd11Q1RNF8 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Samd11Q1RNF8 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Samd11Q1RNF8 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Samd11Q1RNF8 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Samd11Q1RNF8 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Samd11Q1RNF8 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Samd11Q1RNF8 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Samd11Q1RNF8 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Samd11Q1RNF8 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms