Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpne9Q1RLL3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms