Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Trim71Q1PSW8 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trim71Q1PSW8 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
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