Protein–RNA interactions for Protein: Q149G0

UPF0561 protein C2orf68 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q149G0 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q149G0 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q149G0 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q149G0 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q149G0 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q149G0 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q149G0 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q149G0 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q149G0 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q149G0 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q149G0 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q149G0 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q149G0 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Q149G0 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q149G0 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Q149G0 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q149G0 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q149G0 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q149G0 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q149G0 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q149G0 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q149G0 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Q149G0 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q149G0 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q149G0 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q149G0 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q149G0 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q149G0 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q149G0 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q149G0 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q149G0 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q149G0 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q149G0 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q149G0 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q149G0 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q149G0 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q149G0 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q149G0 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q149G0 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q149G0 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q149G0 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q149G0 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q149G0 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q149G0 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q149G0 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q149G0 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q149G0 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q149G0 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q149G0 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q149G0 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q149G0 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q149G0 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q149G0 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q149G0 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q149G0 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q149G0 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q149G0 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q149G0 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q149G0 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Q149G0 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Q149G0 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q149G0 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q149G0 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q149G0 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q149G0 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q149G0 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Q149G0 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q149G0 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q149G0 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q149G0 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Q149G0 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q149G0 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q149G0 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q149G0 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q149G0 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q149G0 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q149G0 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q149G0 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q149G0 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q149G0 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q149G0 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q149G0 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q149G0 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q149G0 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Q149G0 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Q149G0 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Q149G0 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Q149G0 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q149G0 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q149G0 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q149G0 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q149G0 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q149G0 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Q149G0 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Q149G0 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Q149G0 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q149G0 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q149G0 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q149G0 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q149G0 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms