Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rpusd2Q149F1 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rpusd2Q149F1 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rpusd2Q149F1 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rpusd2Q149F1 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rpusd2Q149F1 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rpusd2Q149F1 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rpusd2Q149F1 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rpusd2Q149F1 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rpusd2Q149F1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rpusd2Q149F1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms