Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGT2

Gli2, Zinc finger protein GLI2, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli2Q0VGT2 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Gli2Q0VGT2 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Gli2Q0VGT2 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Gli2Q0VGT2 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Gli2Q0VGT2 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Gli2Q0VGT2 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Gli2Q0VGT2 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Gli2Q0VGT2 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Gli2Q0VGT2 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Gli2Q0VGT2 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gli2Q0VGT2 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gli2Q0VGT2 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gli2Q0VGT2 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Gli2Q0VGT2 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Gli2Q0VGT2 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gli2Q0VGT2 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gli2Q0VGT2 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gli2Q0VGT2 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gli2Q0VGT2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gli2Q0VGT2 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gli2Q0VGT2 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gli2Q0VGT2 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gli2Q0VGT2 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gli2Q0VGT2 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gli2Q0VGT2 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Gli2Q0VGT2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gli2Q0VGT2 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gli2Q0VGT2 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Gli2Q0VGT2 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gli2Q0VGT2 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Gli2Q0VGT2 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gli2Q0VGT2 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gli2Q0VGT2 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gli2Q0VGT2 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gli2Q0VGT2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gli2Q0VGT2 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gli2Q0VGT2 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gli2Q0VGT2 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gli2Q0VGT2 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gli2Q0VGT2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gli2Q0VGT2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gli2Q0VGT2 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gli2Q0VGT2 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gli2Q0VGT2 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gli2Q0VGT2 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gli2Q0VGT2 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gli2Q0VGT2 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Gli2Q0VGT2 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gli2Q0VGT2 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gli2Q0VGT2 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gli2Q0VGT2 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gli2Q0VGT2 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gli2Q0VGT2 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gli2Q0VGT2 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gli2Q0VGT2 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gli2Q0VGT2 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gli2Q0VGT2 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gli2Q0VGT2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gli2Q0VGT2 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gli2Q0VGT2 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Gli2Q0VGT2 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gli2Q0VGT2 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gli2Q0VGT2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gli2Q0VGT2 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gli2Q0VGT2 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gli2Q0VGT2 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gli2Q0VGT2 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gli2Q0VGT2 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gli2Q0VGT2 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gli2Q0VGT2 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gli2Q0VGT2 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gli2Q0VGT2 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gli2Q0VGT2 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gli2Q0VGT2 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Gli2Q0VGT2 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gli2Q0VGT2 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gli2Q0VGT2 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gli2Q0VGT2 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gli2Q0VGT2 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gli2Q0VGT2 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Gli2Q0VGT2 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gli2Q0VGT2 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gli2Q0VGT2 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gli2Q0VGT2 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gli2Q0VGT2 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gli2Q0VGT2 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gli2Q0VGT2 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Gli2Q0VGT2 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Gli2Q0VGT2 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gli2Q0VGT2 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gli2Q0VGT2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gli2Q0VGT2 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gli2Q0VGT2 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gli2Q0VGT2 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gli2Q0VGT2 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gli2Q0VGT2 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gli2Q0VGT2 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gli2Q0VGT2 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gli2Q0VGT2 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gli2Q0VGT2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms