Protein–RNA interactions for Protein: Q0VET5

Lmntd2, Lamin tail domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmntd2Q0VET5 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmntd2Q0VET5 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmntd2Q0VET5 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmntd2Q0VET5 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmntd2Q0VET5 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmntd2Q0VET5 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmntd2Q0VET5 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmntd2Q0VET5 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmntd2Q0VET5 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmntd2Q0VET5 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmntd2Q0VET5 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmntd2Q0VET5 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmntd2Q0VET5 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmntd2Q0VET5 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmntd2Q0VET5 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmntd2Q0VET5 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lmntd2Q0VET5 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmntd2Q0VET5 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmntd2Q0VET5 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmntd2Q0VET5 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmntd2Q0VET5 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmntd2Q0VET5 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmntd2Q0VET5 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmntd2Q0VET5 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmntd2Q0VET5 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmntd2Q0VET5 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmntd2Q0VET5 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmntd2Q0VET5 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmntd2Q0VET5 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmntd2Q0VET5 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmntd2Q0VET5 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lmntd2Q0VET5 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Lmntd2Q0VET5 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Lmntd2Q0VET5 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Lmntd2Q0VET5 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmntd2Q0VET5 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmntd2Q0VET5 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmntd2Q0VET5 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmntd2Q0VET5 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmntd2Q0VET5 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmntd2Q0VET5 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmntd2Q0VET5 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lmntd2Q0VET5 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmntd2Q0VET5 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmntd2Q0VET5 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmntd2Q0VET5 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmntd2Q0VET5 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmntd2Q0VET5 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmntd2Q0VET5 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmntd2Q0VET5 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmntd2Q0VET5 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmntd2Q0VET5 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmntd2Q0VET5 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmntd2Q0VET5 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmntd2Q0VET5 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmntd2Q0VET5 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmntd2Q0VET5 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmntd2Q0VET5 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmntd2Q0VET5 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmntd2Q0VET5 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmntd2Q0VET5 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmntd2Q0VET5 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmntd2Q0VET5 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmntd2Q0VET5 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lmntd2Q0VET5 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmntd2Q0VET5 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmntd2Q0VET5 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmntd2Q0VET5 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmntd2Q0VET5 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmntd2Q0VET5 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmntd2Q0VET5 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmntd2Q0VET5 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmntd2Q0VET5 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmntd2Q0VET5 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmntd2Q0VET5 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmntd2Q0VET5 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmntd2Q0VET5 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmntd2Q0VET5 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmntd2Q0VET5 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmntd2Q0VET5 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmntd2Q0VET5 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmntd2Q0VET5 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmntd2Q0VET5 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmntd2Q0VET5 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmntd2Q0VET5 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmntd2Q0VET5 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmntd2Q0VET5 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmntd2Q0VET5 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmntd2Q0VET5 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmntd2Q0VET5 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Lmntd2Q0VET5 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmntd2Q0VET5 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmntd2Q0VET5 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmntd2Q0VET5 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmntd2Q0VET5 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmntd2Q0VET5 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmntd2Q0VET5 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmntd2Q0VET5 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmntd2Q0VET5 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Lmntd2Q0VET5 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms