Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF8

Stum, Protein stum homolog, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StumQ0VBF8 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
StumQ0VBF8 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
StumQ0VBF8 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
StumQ0VBF8 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
StumQ0VBF8 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
StumQ0VBF8 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
StumQ0VBF8 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
StumQ0VBF8 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
StumQ0VBF8 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
StumQ0VBF8 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
StumQ0VBF8 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
StumQ0VBF8 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
StumQ0VBF8 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
StumQ0VBF8 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
StumQ0VBF8 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
StumQ0VBF8 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
StumQ0VBF8 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
StumQ0VBF8 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
StumQ0VBF8 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
StumQ0VBF8 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
StumQ0VBF8 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
StumQ0VBF8 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
StumQ0VBF8 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
StumQ0VBF8 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
StumQ0VBF8 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
StumQ0VBF8 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
StumQ0VBF8 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
StumQ0VBF8 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
StumQ0VBF8 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
StumQ0VBF8 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
StumQ0VBF8 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
StumQ0VBF8 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
StumQ0VBF8 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
StumQ0VBF8 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
StumQ0VBF8 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
StumQ0VBF8 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
StumQ0VBF8 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
StumQ0VBF8 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
StumQ0VBF8 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
StumQ0VBF8 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms