Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vps8Q0P5W1 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vps8Q0P5W1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vps8Q0P5W1 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vps8Q0P5W1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Vps8Q0P5W1 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Vps8Q0P5W1 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Vps8Q0P5W1 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Vps8Q0P5W1 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Vps8Q0P5W1 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Vps8Q0P5W1 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Vps8Q0P5W1 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Vps8Q0P5W1 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Vps8Q0P5W1 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Vps8Q0P5W1 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Vps8Q0P5W1 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Vps8Q0P5W1 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Vps8Q0P5W1 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Vps8Q0P5W1 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Vps8Q0P5W1 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Vps8Q0P5W1 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Vps8Q0P5W1 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Vps8Q0P5W1 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vps8Q0P5W1 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vps8Q0P5W1 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vps8Q0P5W1 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Vps8Q0P5W1 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Vps8Q0P5W1 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vps8Q0P5W1 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vps8Q0P5W1 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vps8Q0P5W1 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vps8Q0P5W1 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vps8Q0P5W1 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vps8Q0P5W1 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vps8Q0P5W1 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vps8Q0P5W1 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vps8Q0P5W1 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vps8Q0P5W1 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vps8Q0P5W1 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vps8Q0P5W1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vps8Q0P5W1 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vps8Q0P5W1 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vps8Q0P5W1 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vps8Q0P5W1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vps8Q0P5W1 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vps8Q0P5W1 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vps8Q0P5W1 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Vps8Q0P5W1 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vps8Q0P5W1 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vps8Q0P5W1 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vps8Q0P5W1 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vps8Q0P5W1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vps8Q0P5W1 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vps8Q0P5W1 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vps8Q0P5W1 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vps8Q0P5W1 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vps8Q0P5W1 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Vps8Q0P5W1 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vps8Q0P5W1 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vps8Q0P5W1 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vps8Q0P5W1 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vps8Q0P5W1 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vps8Q0P5W1 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vps8Q0P5W1 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vps8Q0P5W1 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vps8Q0P5W1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vps8Q0P5W1 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vps8Q0P5W1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vps8Q0P5W1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vps8Q0P5W1 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vps8Q0P5W1 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vps8Q0P5W1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vps8Q0P5W1 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vps8Q0P5W1 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vps8Q0P5W1 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vps8Q0P5W1 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vps8Q0P5W1 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vps8Q0P5W1 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vps8Q0P5W1 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vps8Q0P5W1 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vps8Q0P5W1 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Vps8Q0P5W1 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vps8Q0P5W1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vps8Q0P5W1 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vps8Q0P5W1 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vps8Q0P5W1 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vps8Q0P5W1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vps8Q0P5W1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vps8Q0P5W1 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vps8Q0P5W1 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vps8Q0P5W1 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vps8Q0P5W1 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vps8Q0P5W1 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vps8Q0P5W1 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vps8Q0P5W1 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vps8Q0P5W1 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vps8Q0P5W1 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vps8Q0P5W1 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Vps8Q0P5W1 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vps8Q0P5W1 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms