Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kcnma1Q08460 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kcnma1Q08460 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kcnma1Q08460 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kcnma1Q08460 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kcnma1Q08460 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kcnma1Q08460 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kcnma1Q08460 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kcnma1Q08460 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kcnma1Q08460 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kcnma1Q08460 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kcnma1Q08460 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kcnma1Q08460 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kcnma1Q08460 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kcnma1Q08460 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kcnma1Q08460 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kcnma1Q08460 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kcnma1Q08460 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kcnma1Q08460 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kcnma1Q08460 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kcnma1Q08460 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kcnma1Q08460 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kcnma1Q08460 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kcnma1Q08460 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Kcnma1Q08460 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kcnma1Q08460 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Kcnma1Q08460 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kcnma1Q08460 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kcnma1Q08460 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kcnma1Q08460 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kcnma1Q08460 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kcnma1Q08460 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kcnma1Q08460 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kcnma1Q08460 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kcnma1Q08460 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kcnma1Q08460 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kcnma1Q08460 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kcnma1Q08460 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kcnma1Q08460 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kcnma1Q08460 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kcnma1Q08460 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kcnma1Q08460 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kcnma1Q08460 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kcnma1Q08460 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kcnma1Q08460 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kcnma1Q08460 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kcnma1Q08460 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kcnma1Q08460 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kcnma1Q08460 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kcnma1Q08460 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kcnma1Q08460 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kcnma1Q08460 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kcnma1Q08460 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kcnma1Q08460 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kcnma1Q08460 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kcnma1Q08460 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kcnma1Q08460 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kcnma1Q08460 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kcnma1Q08460 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kcnma1Q08460 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kcnma1Q08460 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kcnma1Q08460 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kcnma1Q08460 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kcnma1Q08460 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kcnma1Q08460 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kcnma1Q08460 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kcnma1Q08460 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kcnma1Q08460 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kcnma1Q08460 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Kcnma1Q08460 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kcnma1Q08460 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kcnma1Q08460 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kcnma1Q08460 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kcnma1Q08460 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kcnma1Q08460 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kcnma1Q08460 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kcnma1Q08460 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kcnma1Q08460 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kcnma1Q08460 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kcnma1Q08460 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kcnma1Q08460 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms