Protein–RNA interactions for Protein: Q07802

Ebf1, Transcription factor COE1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf1Q07802 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ebf1Q07802 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ebf1Q07802 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ebf1Q07802 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ebf1Q07802 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ebf1Q07802 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ebf1Q07802 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ebf1Q07802 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms