Protein–RNA interactions for Protein: Q07563

Col17a1, Collagen alpha-1(XVII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col17a1Q07563 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Col17a1Q07563 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Col17a1Q07563 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Col17a1Q07563 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Col17a1Q07563 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Col17a1Q07563 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Col17a1Q07563 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Col17a1Q07563 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Col17a1Q07563 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Col17a1Q07563 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Col17a1Q07563 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Col17a1Q07563 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Col17a1Q07563 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Col17a1Q07563 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Col17a1Q07563 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Col17a1Q07563 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Col17a1Q07563 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Col17a1Q07563 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Col17a1Q07563 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Col17a1Q07563 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Col17a1Q07563 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Col17a1Q07563 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Col17a1Q07563 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Col17a1Q07563 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Col17a1Q07563 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Col17a1Q07563 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Col17a1Q07563 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Col17a1Q07563 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Col17a1Q07563 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Col17a1Q07563 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Col17a1Q07563 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Col17a1Q07563 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Col17a1Q07563 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Col17a1Q07563 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Col17a1Q07563 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Col17a1Q07563 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Col17a1Q07563 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Col17a1Q07563 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Col17a1Q07563 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Col17a1Q07563 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Col17a1Q07563 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Col17a1Q07563 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Col17a1Q07563 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Col17a1Q07563 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Col17a1Q07563 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Col17a1Q07563 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Col17a1Q07563 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Col17a1Q07563 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Col17a1Q07563 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Col17a1Q07563 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Col17a1Q07563 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Col17a1Q07563 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Col17a1Q07563 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Col17a1Q07563 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Col17a1Q07563 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Col17a1Q07563 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Col17a1Q07563 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Col17a1Q07563 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Col17a1Q07563 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Col17a1Q07563 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Col17a1Q07563 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Col17a1Q07563 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Col17a1Q07563 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Col17a1Q07563 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Col17a1Q07563 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Col17a1Q07563 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Col17a1Q07563 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Col17a1Q07563 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Col17a1Q07563 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Col17a1Q07563 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Col17a1Q07563 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Col17a1Q07563 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Col17a1Q07563 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Col17a1Q07563 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Col17a1Q07563 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Col17a1Q07563 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Col17a1Q07563 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Col17a1Q07563 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Col17a1Q07563 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Col17a1Q07563 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Col17a1Q07563 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Col17a1Q07563 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Col17a1Q07563 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Col17a1Q07563 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Col17a1Q07563 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Col17a1Q07563 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Col17a1Q07563 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Col17a1Q07563 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Col17a1Q07563 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Col17a1Q07563 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Col17a1Q07563 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Col17a1Q07563 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Col17a1Q07563 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Col17a1Q07563 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Col17a1Q07563 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Col17a1Q07563 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Col17a1Q07563 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Col17a1Q07563 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Col17a1Q07563 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Col17a1Q07563 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms