Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdf3Q07104 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms