Protein–RNA interactions for Protein: Q06831

Sox4, Transcription factor SOX-4, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox4Q06831 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox4Q06831 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox4Q06831 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox4Q06831 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox4Q06831 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox4Q06831 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox4Q06831 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox4Q06831 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox4Q06831 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox4Q06831 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox4Q06831 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox4Q06831 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox4Q06831 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox4Q06831 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox4Q06831 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox4Q06831 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox4Q06831 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox4Q06831 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox4Q06831 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox4Q06831 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox4Q06831 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox4Q06831 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox4Q06831 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox4Q06831 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox4Q06831 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox4Q06831 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox4Q06831 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox4Q06831 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox4Q06831 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox4Q06831 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox4Q06831 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox4Q06831 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox4Q06831 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox4Q06831 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox4Q06831 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox4Q06831 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox4Q06831 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox4Q06831 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox4Q06831 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox4Q06831 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox4Q06831 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox4Q06831 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox4Q06831 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox4Q06831 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox4Q06831 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox4Q06831 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox4Q06831 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox4Q06831 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox4Q06831 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox4Q06831 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox4Q06831 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox4Q06831 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox4Q06831 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox4Q06831 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox4Q06831 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox4Q06831 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox4Q06831 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox4Q06831 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox4Q06831 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox4Q06831 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox4Q06831 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox4Q06831 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox4Q06831 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox4Q06831 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox4Q06831 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox4Q06831 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox4Q06831 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox4Q06831 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox4Q06831 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox4Q06831 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox4Q06831 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox4Q06831 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox4Q06831 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox4Q06831 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox4Q06831 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox4Q06831 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox4Q06831 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox4Q06831 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox4Q06831 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox4Q06831 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox4Q06831 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox4Q06831 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sox4Q06831 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sox4Q06831 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sox4Q06831 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sox4Q06831 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sox4Q06831 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sox4Q06831 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sox4Q06831 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox4Q06831 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox4Q06831 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox4Q06831 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox4Q06831 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox4Q06831 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox4Q06831 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox4Q06831 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox4Q06831 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox4Q06831 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox4Q06831 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sox4Q06831 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms