Protein–RNA interactions for Protein: Q06507

Atf4, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-4, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf4Q06507 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atf4Q06507 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atf4Q06507 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms