Protein–RNA interactions for Protein: Q05AH6

SPINDOC, SPIN1-docking protein, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINDOCQ05AH6 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SPINDOCQ05AH6 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPINDOCQ05AH6 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPINDOCQ05AH6 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPINDOCQ05AH6 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPINDOCQ05AH6 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPINDOCQ05AH6 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPINDOCQ05AH6 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPINDOCQ05AH6 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPINDOCQ05AH6 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SPINDOCQ05AH6 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPINDOCQ05AH6 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPINDOCQ05AH6 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SPINDOCQ05AH6 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPINDOCQ05AH6 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPINDOCQ05AH6 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SPINDOCQ05AH6 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPINDOCQ05AH6 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPINDOCQ05AH6 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPINDOCQ05AH6 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPINDOCQ05AH6 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPINDOCQ05AH6 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPINDOCQ05AH6 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPINDOCQ05AH6 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPINDOCQ05AH6 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPINDOCQ05AH6 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPINDOCQ05AH6 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPINDOCQ05AH6 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SPINDOCQ05AH6 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPINDOCQ05AH6 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPINDOCQ05AH6 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SPINDOCQ05AH6 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPINDOCQ05AH6 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SPINDOCQ05AH6 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SPINDOCQ05AH6 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPINDOCQ05AH6 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPINDOCQ05AH6 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPINDOCQ05AH6 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPINDOCQ05AH6 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPINDOCQ05AH6 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPINDOCQ05AH6 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPINDOCQ05AH6 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPINDOCQ05AH6 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SPINDOCQ05AH6 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPINDOCQ05AH6 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPINDOCQ05AH6 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPINDOCQ05AH6 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPINDOCQ05AH6 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPINDOCQ05AH6 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPINDOCQ05AH6 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPINDOCQ05AH6 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPINDOCQ05AH6 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPINDOCQ05AH6 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SPINDOCQ05AH6 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPINDOCQ05AH6 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPINDOCQ05AH6 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPINDOCQ05AH6 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPINDOCQ05AH6 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPINDOCQ05AH6 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPINDOCQ05AH6 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPINDOCQ05AH6 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPINDOCQ05AH6 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPINDOCQ05AH6 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPINDOCQ05AH6 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPINDOCQ05AH6 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPINDOCQ05AH6 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPINDOCQ05AH6 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SPINDOCQ05AH6 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPINDOCQ05AH6 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPINDOCQ05AH6 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPINDOCQ05AH6 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPINDOCQ05AH6 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SPINDOCQ05AH6 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms