Protein–RNA interactions for Protein: Q05186

Rcn1, Reticulocalbin-1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcn1Q05186 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rcn1Q05186 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rcn1Q05186 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms