Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apoc2Q05020 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apoc2Q05020 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apoc2Q05020 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apoc2Q05020 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Apoc2Q05020 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apoc2Q05020 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apoc2Q05020 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apoc2Q05020 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Apoc2Q05020 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Apoc2Q05020 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Apoc2Q05020 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Apoc2Q05020 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Apoc2Q05020 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Apoc2Q05020 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Apoc2Q05020 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Apoc2Q05020 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Apoc2Q05020 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Apoc2Q05020 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Apoc2Q05020 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Apoc2Q05020 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Apoc2Q05020 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Apoc2Q05020 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Apoc2Q05020 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Apoc2Q05020 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Apoc2Q05020 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Apoc2Q05020 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Apoc2Q05020 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Apoc2Q05020 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Apoc2Q05020 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Apoc2Q05020 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Apoc2Q05020 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Apoc2Q05020 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Apoc2Q05020 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apoc2Q05020 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apoc2Q05020 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apoc2Q05020 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apoc2Q05020 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apoc2Q05020 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apoc2Q05020 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apoc2Q05020 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apoc2Q05020 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apoc2Q05020 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apoc2Q05020 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apoc2Q05020 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apoc2Q05020 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apoc2Q05020 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apoc2Q05020 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apoc2Q05020 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apoc2Q05020 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Apoc2Q05020 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apoc2Q05020 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apoc2Q05020 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apoc2Q05020 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apoc2Q05020 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apoc2Q05020 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apoc2Q05020 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apoc2Q05020 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apoc2Q05020 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apoc2Q05020 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apoc2Q05020 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apoc2Q05020 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Apoc2Q05020 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apoc2Q05020 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apoc2Q05020 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apoc2Q05020 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apoc2Q05020 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apoc2Q05020 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apoc2Q05020 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Apoc2Q05020 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Apoc2Q05020 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apoc2Q05020 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apoc2Q05020 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apoc2Q05020 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apoc2Q05020 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apoc2Q05020 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apoc2Q05020 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apoc2Q05020 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apoc2Q05020 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apoc2Q05020 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apoc2Q05020 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apoc2Q05020 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apoc2Q05020 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Apoc2Q05020 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apoc2Q05020 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apoc2Q05020 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apoc2Q05020 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apoc2Q05020 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apoc2Q05020 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apoc2Q05020 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apoc2Q05020 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apoc2Q05020 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apoc2Q05020 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apoc2Q05020 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apoc2Q05020 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apoc2Q05020 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Apoc2Q05020 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apoc2Q05020 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Apoc2Q05020 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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