Protein–RNA interactions for Protein: Q04899

Cdk18, Cyclin-dependent kinase 18, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk18Q04899 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms