Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sox12Q04890 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sox12Q04890 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sox12Q04890 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sox12Q04890 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sox12Q04890 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sox12Q04890 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sox12Q04890 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sox12Q04890 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sox12Q04890 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sox12Q04890 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Sox12Q04890 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Sox12Q04890 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sox12Q04890 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sox12Q04890 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sox12Q04890 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sox12Q04890 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sox12Q04890 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sox12Q04890 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sox12Q04890 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 AC154849.3-201ENSMUST00000223733 1660 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 1700029E06Rik-201ENSMUST00000189036 757 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 Gm29107-201ENSMUST00000190910 347 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 Gm20618-202ENSMUST00000177482 1227 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 Gm28707-201ENSMUST00000186134 558 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 Gm14542-201ENSMUST00000118460 1248 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 Crisp4-201ENSMUST00000026876 1252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms