Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Nf1Q04690 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms