Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms