Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tff2Q03404 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tff2Q03404 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tff2Q03404 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tff2Q03404 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tff2Q03404 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tff2Q03404 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tff2Q03404 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tff2Q03404 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tff2Q03404 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tff2Q03404 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tff2Q03404 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tff2Q03404 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tff2Q03404 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tff2Q03404 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tff2Q03404 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tff2Q03404 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tff2Q03404 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tff2Q03404 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tff2Q03404 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tff2Q03404 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tff2Q03404 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tff2Q03404 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tff2Q03404 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tff2Q03404 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tff2Q03404 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tff2Q03404 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tff2Q03404 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tff2Q03404 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tff2Q03404 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tff2Q03404 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tff2Q03404 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tff2Q03404 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tff2Q03404 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Tff2Q03404 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tff2Q03404 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tff2Q03404 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Tff2Q03404 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tff2Q03404 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tff2Q03404 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tff2Q03404 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tff2Q03404 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tff2Q03404 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tff2Q03404 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tff2Q03404 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tff2Q03404 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tff2Q03404 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tff2Q03404 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Tff2Q03404 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tff2Q03404 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Tff2Q03404 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tff2Q03404 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms