Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msx2Q03358 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms