Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
GscQ02591 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GscQ02591 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GscQ02591 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GscQ02591 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GscQ02591 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GscQ02591 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GscQ02591 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GscQ02591 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
GscQ02591 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GscQ02591 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GscQ02591 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GscQ02591 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GscQ02591 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GscQ02591 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GscQ02591 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GscQ02591 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GscQ02591 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GscQ02591 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GscQ02591 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GscQ02591 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GscQ02591 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GscQ02591 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GscQ02591 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GscQ02591 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GscQ02591 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GscQ02591 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GscQ02591 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GscQ02591 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GscQ02591 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GscQ02591 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GscQ02591 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GscQ02591 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GscQ02591 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GscQ02591 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GscQ02591 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GscQ02591 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GscQ02591 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GscQ02591 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GscQ02591 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GscQ02591 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GscQ02591 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GscQ02591 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GscQ02591 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GscQ02591 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GscQ02591 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GscQ02591 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GscQ02591 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GscQ02591 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GscQ02591 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GscQ02591 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GscQ02591 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GscQ02591 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GscQ02591 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GscQ02591 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GscQ02591 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GscQ02591 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GscQ02591 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GscQ02591 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GscQ02591 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GscQ02591 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GscQ02591 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GscQ02591 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GscQ02591 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GscQ02591 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GscQ02591 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GscQ02591 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GscQ02591 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GscQ02591 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GscQ02591 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GscQ02591 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GscQ02591 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GscQ02591 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GscQ02591 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GscQ02591 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GscQ02591 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GscQ02591 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GscQ02591 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GscQ02591 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GscQ02591 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GscQ02591 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GscQ02591 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GscQ02591 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GscQ02591 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GscQ02591 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GscQ02591 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GscQ02591 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GscQ02591 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GscQ02591 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GscQ02591 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GscQ02591 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GscQ02591 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GscQ02591 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GscQ02591 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GscQ02591 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GscQ02591 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GscQ02591 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GscQ02591 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GscQ02591 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GscQ02591 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms