Protein–RNA interactions for Protein: Q02525

Zfp39, Zinc finger protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp39Q02525 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms