Protein–RNA interactions for Protein: Q02284

Htr1f, 5-hydroxytryptamine receptor 1F, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr1fQ02284 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Htr1fQ02284 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Htr1fQ02284 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Htr1fQ02284 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Htr1fQ02284 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Htr1fQ02284 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Htr1fQ02284 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Htr1fQ02284 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Htr1fQ02284 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Htr1fQ02284 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Htr1fQ02284 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Htr1fQ02284 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Htr1fQ02284 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Htr1fQ02284 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Htr1fQ02284 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Htr1fQ02284 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Htr1fQ02284 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Htr1fQ02284 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Htr1fQ02284 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Htr1fQ02284 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Htr1fQ02284 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Htr1fQ02284 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Htr1fQ02284 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Htr1fQ02284 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Htr1fQ02284 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Htr1fQ02284 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Htr1fQ02284 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Htr1fQ02284 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Htr1fQ02284 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Htr1fQ02284 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Htr1fQ02284 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Htr1fQ02284 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Htr1fQ02284 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Htr1fQ02284 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Htr1fQ02284 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Htr1fQ02284 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Htr1fQ02284 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Htr1fQ02284 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Htr1fQ02284 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Htr1fQ02284 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Htr1fQ02284 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Htr1fQ02284 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Htr1fQ02284 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Htr1fQ02284 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Htr1fQ02284 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Htr1fQ02284 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Htr1fQ02284 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Htr1fQ02284 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Htr1fQ02284 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Htr1fQ02284 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Htr1fQ02284 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Htr1fQ02284 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Htr1fQ02284 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Htr1fQ02284 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Htr1fQ02284 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Htr1fQ02284 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Htr1fQ02284 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Htr1fQ02284 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Htr1fQ02284 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Htr1fQ02284 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Htr1fQ02284 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Htr1fQ02284 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Htr1fQ02284 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Htr1fQ02284 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Htr1fQ02284 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Htr1fQ02284 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Htr1fQ02284 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Htr1fQ02284 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Htr1fQ02284 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Htr1fQ02284 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Htr1fQ02284 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Htr1fQ02284 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Htr1fQ02284 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Htr1fQ02284 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Htr1fQ02284 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Htr1fQ02284 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Htr1fQ02284 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Htr1fQ02284 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Htr1fQ02284 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Htr1fQ02284 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Htr1fQ02284 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Htr1fQ02284 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Htr1fQ02284 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Htr1fQ02284 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Htr1fQ02284 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Htr1fQ02284 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Htr1fQ02284 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Htr1fQ02284 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Htr1fQ02284 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Htr1fQ02284 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Htr1fQ02284 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Htr1fQ02284 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Htr1fQ02284 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Htr1fQ02284 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Htr1fQ02284 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Htr1fQ02284 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Htr1fQ02284 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Htr1fQ02284 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Htr1fQ02284 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Htr1fQ02284 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms